Using Siphon Hole Morphometrics to Identify, Count, and Measure Soft-shell Clams (Mya arenaria)

PURPOSE:

Establishing efficient, non-destructive sampling methods for clam population assessments.

DESCRIPTION:

In the Gulf of St. Lawrence (GSL) Management Region, clam assessments are uncommon due to limited resources and the labour-intensive nature of sampling clam beds. Furthermore, clam assessments typically rely on destructive sampling that disturbs sediment and removes animals from their habitat. Establishing efficient, non-destructive sampling methods for clam population assessments can reduce the impact of scientific sampling on these habitats and provide for more efficient monitoring. In this study, we tested the idea that visually observing siphon holes on the sediment surface could predict the presence, number, and size of soft-shell clams across different sites in the southern GSL. Siphon holes reasonably predicted the presence, number, and size/biomass of soft-shell clams in most, but not all, sites. Thus, in many habitats in the GSL, siphon holes can be used for population assessments, providing a powerful tool to enhance Science advice to fisheries managers.

Data was collected at the following sites:

• Maisonnette, Parc Maisonnette, Maisonnette, New Brunswick, Canada

• Kouchibouguac, Loggiecroft wharf, Kouchibouguac National Park, New Brunswick, Canada

• Shemogue, Amos Point Road, Little Shemogue, New Brunswick, Canada

• Powell's Cove, Powell's Point Provincial Park, Little Harbour, Nova Scotia, Canada

PARAMETERS COLLECTED:

• Clam abundance

• Clam biomass (total sample)

• Clam size (length, weight)

• Siphon hole abundance

• Siphon hole size

• Siphon hole characterization (i.e., identification of actual clam based on shape)

• Seawater temperature

• Sediment grain size

• Sediment organic content (%)

• Sediment relative moisture content (%)

NOTES ON QUALITY CONTROL:

Original data entry by Jillian Hunt and/or Isabelle Brennan. Data checked and validated prior to analysis by Jeff Clements. Data further checked and validated prior to publication by Amélie Robichaud.

PHYSICAL SAMPLE DETAILS:

No physical samples retained.

• Clam samples returned back to original habitat after measuring and weighing in the field.

• Sediment core samples stored in walk-in freezer and discarded after processing and analysis.

SAMPLING METHODS:

i. Identifying, counting, weighing, and measuring (with calipers) clams

ii. Identifying, counting, and measuring (with calipers) clam siphon holes

iii. Seawater temperature monitoring via data loggers

iv. Sediment grain size, organic content, and moisture content analysis

USE LIMITATION:

To ensure scientific integrity and appropriate use of the data, we would encourage you to contact the data custodian.

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• Hand Sampling...
• Marine biology
• Mya arenaria
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• Oceans
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Informations supplémentaires

• Niveau de maturité 1 (54%)
• Niveau de maturité 2 (38%)
• Niveau de maturité 3 (0%)
• Niveau de maturité 4 (0%)
• Niveau de maturité 5 (0%)
• Niveau de maturité 6 (0%)

Champ	Valeur
Dernière mise à jour	octobre 20, 2025, 02:50 (TU)
Créé	octobre 20, 2025, 02:50 (TU)
Domaine / Sujet Domaine ou sujet du jeu de données catalogué.	Biota, Environment, Oceans
Titre Titre du jeu de données.	Using Siphon Hole Morphometrics to Identify, Count, and Measure Soft-shell Clams (Mya arenaria)
Description Une description du jeu de données.	PURPOSE: Establishing efficient, non-destructive sampling methods for clam population assessments. DESCRIPTION: In the Gulf of St. Lawrence (GSL) Management Region, clam assessments are uncommon due to limited resources and the labour-intensive nature of sampling clam beds. Furthermore, clam assessments typically rely on destructive sampling that disturbs sediment and removes animals from their habitat. Establishing efficient, non-destructive sampling methods for clam population assessments can reduce the impact of scientific sampling on these habitats and provide for more efficient monitoring. In this study, we tested the idea that visually observing siphon holes on the sediment surface could predict the presence, number, and size of soft-shell clams across different sites in the southern GSL. Siphon holes reasonably predicted the presence, number, and size/biomass of soft-shell clams in most, but not all, sites. Thus, in many habitats in the GSL, siphon holes can be used for population assessments, providing a powerful tool to enhance Science advice to fisheries managers. Data was collected at the following sites: Maisonnette, Parc Maisonnette, Maisonnette, New Brunswick, Canada Kouchibouguac, Loggiecroft wharf, Kouchibouguac National Park, New Brunswick, Canada Shemogue, Amos Point Road, Little Shemogue, New Brunswick, Canada Powell's Cove, Powell's Point Provincial Park, Little Harbour, Nova Scotia, Canada PARAMETERS COLLECTED: Clam abundance Clam biomass (total sample) Clam size (length, weight) Siphon hole abundance Siphon hole size Siphon hole characterization (i.e., identification of actual clam based on shape) Seawater temperature Sediment grain size Sediment organic content (%) Sediment relative moisture content (%) NOTES ON QUALITY CONTROL: Original data entry by Jillian Hunt and/or Isabelle Brennan. Data checked and validated prior to analysis by Jeff Clements. Data further checked and validated prior to publication by Amélie Robichaud. PHYSICAL SAMPLE DETAILS: No physical samples retained. Clam samples returned back to original habitat after measuring and weighing in the field. Sediment core samples stored in walk-in freezer and discarded after processing and analysis. SAMPLING METHODS: i. Identifying, counting, weighing, and measuring (with calipers) clams ii. Identifying, counting, and measuring (with calipers) clam siphon holes iii. Seawater temperature monitoring via data loggers iv. Sediment grain size, organic content, and moisture content analysis USE LIMITATION: To ensure scientific integrity and appropriate use of the data, we would encourage you to contact the data custodian.
Étiquettes / Mots-clés Mots-clés/étiquettes catégorisant le jeu de données.	Aquatic wildlife BENTHIC Clams Fisheries Gulf of St. Lawrence Hand Sampling... Marine biology Mya arenaria Nature and Environment Oceans Science and Technology
Format (CSV, XLS, TXT, PDF, etc.) Format de fichier du jeu de données.
Taille du jeu de données Taille du jeu de données en mégaoctets.
Identifiant des métadonnées Identifiant des métadonnées — peut être utilisé comme identifiant unique pour l’entrée du catalogue.
Date de publication Date de publication du jeu de données.	2024-05-13
Période temporelle des données (date de début) Date de début des données dans le jeu de données.
Période temporelle des données (date de fin) Date de fin des données temporelles du jeu de données.
Zone géospatiale couverte Région spatiale ou lieu nommé couvert par le jeu de données.

Champ	Valeur
Catégorie d’accès Type d’accès accordé pour le jeu de données (ouvert, restreint, service, etc.).
Licence Licence utilisée pour accéder au jeu de données.	Open Government Licence - Canada
Restrictions d’utilisation Restrictions d’utilisation des données.
Emplacement Emplacement du jeu de données.	https://open.canada.ca/data/en/dataset/c48c64f4-92cd-11ee-bd12-d17b9d44bf6a
Service de données Service de données pour accéder à un jeu de données.
Propriétaire Propriétaire du jeu de données.	Fisheries and Oceans Canada | Pêches et Océans Canada
Point de contact Qui contacter concernant l’accès ?	Government of Canada; Fisheries and Oceans Canada, Government of Canada; Fisheries and Oceans Canada, 506-381-4731, 506-229-7798, [email protected], [email protected]
Courriel du point de contact Courriel à utiliser pour l’accès ?
Éditeur Éditeur du jeu de données.
Courriel de l’éditeur Adresse courriel de l’éditeur.	[email protected]
Auteur Auteur du jeu de données.
Courriel de l'auteur Adresse courriel de l’auteur.
Date d’accès Date à laquelle les données et métadonnées ont été consultées.

Champ	Valeur
Identifiant Identifiant unique du jeu de données.
Langue Langue(s) du jeu de données
Lien vers la description du jeu de données Une URL vers un document externe décrivant le jeu de données.
Identifiant persistant Les données sont identifiées par un identifiant persistant.
Identifiant globalement unique Les données sont identifiées par un identifiant persistant et globalement unique.
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Type de portail Type de plateforme du portail source.

Champ	Valeur
Version Version du jeu de données	None
Source Source du jeu de données.	None
Notes de version Notes de version à propos du jeu de données.
Est une version d’un autre jeu de données Lien vers le jeu de données dont celui-ci est une version.
Autres versions Lien vers les jeux de données qui en sont des versions.
Texte de provenance Texte de provenance des données.
URL de provenance URL de provenance des données.
Résolution temporelle Décrit la granularité des données temporelles dans le jeu de données.
Résolution géospatiale en mètres Décrit la granularité (en mètres) des données géospatiales dans le jeu de données.
Résolution géospatiale (par régions) Décrit la granularité (par régions) des données géospatiales dans le jeu de données.

Champ	Valeur
Permission de la communauté autochtone Qui détient la permission de la communauté autochtone. Qui contacter pour l’accès à un jeu de données concernant des communautés autochtones.
Permission communautaire Permission communautaire (qui a accordé la permission).
Les communautés autochtones concernées par le jeu de données Communautés autochtones dont sont issues les données.

Champ	Valeur
Nombre de lignes de données Pour un jeu de données tabulaire, nombre total de lignes.
Nombre de colonnes de données Pour un jeu de données tabulaire, nombre total de colonnes uniques.
Nombre de cellules de données Pour un jeu de données tabulaire, nombre total de cellules contenant des données.
Nombre de relations de données Pour un jeu de données RDF, nombre total de triplets.
Nombre d’entités Pour un jeu de données RDF, nombre total d’entités.
Nombre de propriétés de données Pour un jeu de données RDF, nombre total de propriétés uniques utilisées par les triplets.
Qualité des données Décrit la qualité des données du jeu de données.
Métrique de qualité des données Une métrique utilisée pour mesurer la qualité des données, telle que les valeurs manquantes ou les formats invalides.

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