Pacific Marine Ecological Classification System and its Application to the Northern and Southern Shelf Bioregions

Description:

Biophysical Units:

Under the Pacific Marine Ecological Classification System (PMECS; DFO 2016; Rubidge et al. 2016), biophysical units are areas of distinct physiographic and oceanographic conditions and processes that shape species composition at spatial extents of 1000s of km.

Geomorphic units:

Geomorphic units or geozones are discrete geomorphological structures at the scale of 100s of km that are assumed to have distinctive biological assemblages (e.g., plateaus, ridges, seamounts, canyons). Although the spatial scale of geomorphic units is nested within biophysical units, a single geomorphic unit such as a trough may span more than one biophysical unit.

The following 5 layers are included in this geodatabase:

  1. Biophysical_Units_L4A - Predicted PMECS Biophysical Units (Level 4A) output from the random forest analysis

  2. Biophysical_Units_L4B - Predicted PMECS Biophysical Units (Level 4B) output from the random forest analysis

  3. Biophysical_Units_ProbAssign_L4AB - Layer showing the probability that a grid cell was assigned to a given biophysical unit in the final random forest predictive modelling step

  4. Cluster_L4AB - Layer showing the output of species assemblage cluster analysis

  5. Geomorphic_Units - Geomorphic units for the BC coast that combines geomorphic units produced by Rubidge et al. 2016) and Proudfoot and Robb (2022).

Methods:

Biophysical Units:

Rubidge et al. (2016) used a two-step process to identify biophysical units in British Columbia. First, a cluster analysis based on the similarity of species composition was used to group sites with similar species into distinct biological assemblages. Second, a random forest analysis was used to identify environmental correlates of the biological assemblages identified by the cluster analysis and to predict and assign the biological assemblage present in areas with too few biological data. Two different similarity thresholds were used to identify two levels (4A, 4B) of biophysical units; see Rubidge et al. (2016) for details. Indicator species for each assemblage (biophysical unit) were also identified.

Geomorphic units:

Rubidge et al. (2016) used the benthic terrain modeller (BTM) tool with broad and fine-scale benthic positioning index (BPI) parameters to define geomorphic units on the continental shelf in the Northern Shelf Bioregion and the continental slope in both the Northern Shelf Bioregion and Southern Shelf Bioregion. In 2022, geomorphic units were produced for the Strait of Georgia and Southern Shelf Bioregions following the same methods as Rubidge et al. (2016) (Proudfoot and Robb 2022). The geomorphic units produced as part of the PMECS process were merged with the geomorphic units produced for the Strait of Georgia and Southern Shelf bioregions to produce a continuous spatial data product representing geomorphic units for the Canadian Pacific continental shelf and slope. After merging, the geomorphic units produced in 2016 were unchanged (i.e., they are consistent with the original geomorphic units described in Rubidge et al. 2016).

Data Sources:

From Rubidge et al. (2016): Species data was taken from Fisheries and Oceans Canada (DFO) standardized fisheries-independent research surveys: groundfish trawl and long-line (2003-2013), Tanner Crab trawl and trap (2000–2006), and Dungeness Crab trap (2000–2014). Environmental data came from NASA, the Canadian Hydrographic Service, Fisheries and Oceans Canada, Bio-ORACLE, and elsewhere (details in Rubidge et al. 2016). From Proudfoot and Robb (2022): bathymetry data came from Natural Resources Canada (details in Proudfoot and Robb 2022).

Uncertainties:

The data is intended for use at the bioregional scale, and caution should be used for finer-scale analyses.

Jeux de données disponibles au téléchargement

Informations supplémentaires

Champ Valeur
Dernière mise à jour octobre 20, 2025, 02:40 (TU)
Créé octobre 20, 2025, 02:40 (TU)
Domaine / Sujet
Domaine ou sujet du jeu de données catalogué.
Environment, Oceans
Titre
Titre du jeu de données.
Pacific Marine Ecological Classification System and its Application to the Northern and Southern Shelf Bioregions
Description
Une description du jeu de données.

Description:

Biophysical Units:

Under the Pacific Marine Ecological Classification System (PMECS; DFO 2016; Rubidge et al. 2016), biophysical units are areas of distinct physiographic and oceanographic conditions and processes that shape species composition at spatial extents of 1000s of km.

Geomorphic units:

Geomorphic units or geozones are discrete geomorphological structures at the scale of 100s of km that are assumed to have distinctive biological assemblages (e.g., plateaus, ridges, seamounts, canyons). Although the spatial scale of geomorphic units is nested within biophysical units, a single geomorphic unit such as a trough may span more than one biophysical unit.

The following 5 layers are included in this geodatabase:

  1. Biophysical_Units_L4A - Predicted PMECS Biophysical Units (Level 4A) output from the random forest analysis

  2. Biophysical_Units_L4B - Predicted PMECS Biophysical Units (Level 4B) output from the random forest analysis

  3. Biophysical_Units_ProbAssign_L4AB - Layer showing the probability that a grid cell was assigned to a given biophysical unit in the final random forest predictive modelling step

  4. Cluster_L4AB - Layer showing the output of species assemblage cluster analysis

  5. Geomorphic_Units - Geomorphic units for the BC coast that combines geomorphic units produced by Rubidge et al. 2016) and Proudfoot and Robb (2022).

Methods:

Biophysical Units:

Rubidge et al. (2016) used a two-step process to identify biophysical units in British Columbia. First, a cluster analysis based on the similarity of species composition was used to group sites with similar species into distinct biological assemblages. Second, a random forest analysis was used to identify environmental correlates of the biological assemblages identified by the cluster analysis and to predict and assign the biological assemblage present in areas with too few biological data. Two different similarity thresholds were used to identify two levels (4A, 4B) of biophysical units; see Rubidge et al. (2016) for details. Indicator species for each assemblage (biophysical unit) were also identified.

Geomorphic units:

Rubidge et al. (2016) used the benthic terrain modeller (BTM) tool with broad and fine-scale benthic positioning index (BPI) parameters to define geomorphic units on the continental shelf in the Northern Shelf Bioregion and the continental slope in both the Northern Shelf Bioregion and Southern Shelf Bioregion. In 2022, geomorphic units were produced for the Strait of Georgia and Southern Shelf Bioregions following the same methods as Rubidge et al. (2016) (Proudfoot and Robb 2022). The geomorphic units produced as part of the PMECS process were merged with the geomorphic units produced for the Strait of Georgia and Southern Shelf bioregions to produce a continuous spatial data product representing geomorphic units for the Canadian Pacific continental shelf and slope. After merging, the geomorphic units produced in 2016 were unchanged (i.e., they are consistent with the original geomorphic units described in Rubidge et al. 2016).

Data Sources:

From Rubidge et al. (2016): Species data was taken from Fisheries and Oceans Canada (DFO) standardized fisheries-independent research surveys: groundfish trawl and long-line (2003-2013), Tanner Crab trawl and trap (2000–2006), and Dungeness Crab trap (2000–2014). Environmental data came from NASA, the Canadian Hydrographic Service, Fisheries and Oceans Canada, Bio-ORACLE, and elsewhere (details in Rubidge et al. 2016). From Proudfoot and Robb (2022): bathymetry data came from Natural Resources Canada (details in Proudfoot and Robb 2022).

Uncertainties:

The data is intended for use at the bioregional scale, and caution should be used for finer-scale analyses.
Étiquettes / Mots-clés
Mots-clés/étiquettes catégorisant le jeu de données.
Format (CSV, XLS, TXT, PDF, etc.)
Format de fichier du jeu de données.
Taille du jeu de données
Taille du jeu de données en mégaoctets.
Identifiant des métadonnées
Identifiant des métadonnées — peut être utilisé comme identifiant unique pour l’entrée du catalogue.
Date de publication
Date de publication du jeu de données.
2021-03-30
Période temporelle des données (date de début)
Date de début des données dans le jeu de données.
Période temporelle des données (date de fin)
Date de fin des données temporelles du jeu de données.
Zone géospatiale couverte
Région spatiale ou lieu nommé couvert par le jeu de données.
Champ Valeur
Catégorie d’accès
Type d’accès accordé pour le jeu de données (ouvert, restreint, service, etc.).
Licence
Licence utilisée pour accéder au jeu de données.
Open Government Licence - Canada
Restrictions d’utilisation
Restrictions d’utilisation des données.
Emplacement
Emplacement du jeu de données.
https://open.canada.ca/data/en/dataset/abbfe250-8202-4822-8bd1-aaaf393bbfd5
Service de données
Service de données pour accéder à un jeu de données.
Propriétaire
Propriétaire du jeu de données.
Fisheries and Oceans Canada | Pêches et Océans Canada
Point de contact
Qui contacter concernant l’accès ?
Government of Canada; Fisheries and Oceans Canada; Science/MSEA Section, 250-363-6411, [email protected]
Courriel du point de contact
Courriel à utiliser pour l’accès ?
Éditeur
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Courriel de l’éditeur
Adresse courriel de l’éditeur.
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Les données sont identifiées par un identifiant persistant et globalement unique.
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Le jeu de données contient-il des données sur des individus ?
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Le jeu de données contient-il des données identifiables sur des individus ?
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Type de portail
Type de plateforme du portail source.
Champ Valeur
Version
Version du jeu de données
None
Source
Source du jeu de données.
None
Notes de version
Notes de version à propos du jeu de données.
Est une version d’un autre jeu de données
Lien vers le jeu de données dont celui-ci est une version.
Autres versions
Lien vers les jeux de données qui en sont des versions.
Texte de provenance
Texte de provenance des données.
URL de provenance
URL de provenance des données.
Résolution temporelle
Décrit la granularité des données temporelles dans le jeu de données.
Résolution géospatiale en mètres
Décrit la granularité (en mètres) des données géospatiales dans le jeu de données.
Résolution géospatiale (par régions)
Décrit la granularité (par régions) des données géospatiales dans le jeu de données.
Champ Valeur
Permission de la communauté autochtone
Qui détient la permission de la communauté autochtone. Qui contacter pour l’accès à un jeu de données concernant des communautés autochtones.
Permission communautaire
Permission communautaire (qui a accordé la permission).
Les communautés autochtones concernées par le jeu de données
Communautés autochtones dont sont issues les données.
Champ Valeur
Nombre de lignes de données
Pour un jeu de données tabulaire, nombre total de lignes.
Nombre de colonnes de données
Pour un jeu de données tabulaire, nombre total de colonnes uniques.
Nombre de cellules de données
Pour un jeu de données tabulaire, nombre total de cellules contenant des données.
Nombre de relations de données
Pour un jeu de données RDF, nombre total de triplets.
Nombre d’entités
Pour un jeu de données RDF, nombre total d’entités.
Nombre de propriétés de données
Pour un jeu de données RDF, nombre total de propriétés uniques utilisées par les triplets.
Qualité des données
Décrit la qualité des données du jeu de données.
Métrique de qualité des données
Une métrique utilisée pour mesurer la qualité des données, telle que les valeurs manquantes ou les formats invalides.

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