Species Distribution Modelling of Corals and Sponges in the Maritimes Region for Use in the Identification of Significant Benthic Areas
Effective fisheries and habitat management processes require knowledge of the distribution of areas of high ecological or biological significance. On the Scotian Shelf and Slope, a number of benthic ecologically or biologically significant areas consisting of habitat-forming species such as sponges and deep-water corals have been identified. However, knowledge of their spatial distribution is largely based on targeted surveys that are limited in their spatial extent. We used a species distribution modelling approach called random forest (RF) to predict the probability of occurrence and biomass of sponges, sea pens, and large and small gorgonian corals across the entire spatial extent of Fisheries and Oceans Canada’s (DFO) Maritimes Region. We also modelled the rare sponge Vazella pourtalesi, which forms the largest known aggregation of its kind on the Scotian Shelf. We utilized a number of data sources including DFO multispecies trawl catch data and in situ benthic imagery observations. Most models had excellent predictive capacity with cross-validated Area Under the Receiver Operating Characteristic Curve (AUC) values ranging from 0.760 to 0.977. Areas of suitable habitat were identified for each taxon and were contrasted against their known distribution and when applicable, the location of closure areas designated for their protection. Generalized additive models (GAMs) were developed to predict the biomass distribution of each taxonomic group and serve as a comparison to the RF models. The RF and GAM models provided comparable results, although GAMs provided superior predictions of biomass along the continental slope for some taxonomic groups. In the absence of data observations, the results of this study could be used to identify the potential distribution of sensitive benthic taxa for use in fisheries and habitat management applications. These results could also be used to refine significant concentrations of these taxa as identified through the kernel density analyses.
Cite this data as: Beazley, Lindsay; Kenchington, Ellen; Murillo-Perez, Javier; Lirette, Camille; Guijarro-Sabaniel, Javier; McMillan, Andrew; Knudby, Anders (2019). Species Distribution Modelling of Corals and Sponges in the Maritimes Region for Use in the Identification of Significant Benthic Areas. Published July 2023. Ocean Ecosystems Science Division, Fisheries and Oceans Canada, Dartmouth, N.S. https://open.canada.ca/data/en/dataset/356e92f3-5bf3-4810-98b1-3e10cd7742aa
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Informations supplémentaires
| Champ | Valeur |
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| Dernière mise à jour | octobre 20, 2025, 02:41 (TU) |
| Créé | octobre 20, 2025, 02:41 (TU) |
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Domaine / Sujet
Domaine ou sujet du jeu de données catalogué.
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Biota, Environment, Oceans |
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Titre
Titre du jeu de données.
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Species Distribution Modelling of Corals and Sponges in the Maritimes Region for Use in the Identification of Significant Benthic Areas |
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Description
Une description du jeu de données.
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Effective fisheries and habitat management processes require knowledge of the distribution of areas of high ecological or biological significance. On the Scotian Shelf and Slope, a number of benthic ecologically or biologically significant areas consisting of habitat-forming species such as sponges and deep-water corals have been identified. However, knowledge of their spatial distribution is largely based on targeted surveys that are limited in their spatial extent. We used a species distribution modelling approach called random forest (RF) to predict the probability of occurrence and biomass of sponges, sea pens, and large and small gorgonian corals across the entire spatial extent of Fisheries and Oceans Canada’s (DFO) Maritimes Region. We also modelled the rare sponge Vazella pourtalesi, which forms the largest known aggregation of its kind on the Scotian Shelf. We utilized a number of data sources including DFO multispecies trawl catch data and in situ benthic imagery observations. Most models had excellent predictive capacity with cross-validated Area Under the Receiver Operating Characteristic Curve (AUC) values ranging from 0.760 to 0.977. Areas of suitable habitat were identified for each taxon and were contrasted against their known distribution and when applicable, the location of closure areas designated for their protection. Generalized additive models (GAMs) were developed to predict the biomass distribution of each taxonomic group and serve as a comparison to the RF models. The RF and GAM models provided comparable results, although GAMs provided superior predictions of biomass along the continental slope for some taxonomic groups. In the absence of data observations, the results of this study could be used to identify the potential distribution of sensitive benthic taxa for use in fisheries and habitat management applications. These results could also be used to refine significant concentrations of these taxa as identified through the kernel density analyses. Cite this data as: Beazley, Lindsay; Kenchington, Ellen; Murillo-Perez, Javier; Lirette, Camille; Guijarro-Sabaniel, Javier; McMillan, Andrew; Knudby, Anders (2019). Species Distribution Modelling of Corals and Sponges in the Maritimes Region for Use in the Identification of Significant Benthic Areas. Published July 2023. Ocean Ecosystems Science Division, Fisheries and Oceans Canada, Dartmouth, N.S. https://open.canada.ca/data/en/dataset/356e92f3-5bf3-4810-98b1-3e10cd7742aa |
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Étiquettes / Mots-clés
Mots-clés/étiquettes catégorisant le jeu de données.
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Format (CSV, XLS, TXT, PDF, etc.)
Format de fichier du jeu de données.
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Taille du jeu de données
Taille du jeu de données en mégaoctets.
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Identifiant des métadonnées
Identifiant des métadonnées — peut être utilisé comme identifiant unique pour l’entrée du catalogue.
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Date de publication
Date de publication du jeu de données.
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2019-01-21 |
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Période temporelle des données (date de début)
Date de début des données dans le jeu de données.
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Période temporelle des données (date de fin)
Date de fin des données temporelles du jeu de données.
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Zone géospatiale couverte
Région spatiale ou lieu nommé couvert par le jeu de données.
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| Champ | Valeur |
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Catégorie d’accès
Type d’accès accordé pour le jeu de données (ouvert, restreint, service, etc.).
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Licence
Licence utilisée pour accéder au jeu de données.
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Open Government Licence - Canada |
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Restrictions d’utilisation
Restrictions d’utilisation des données.
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Emplacement
Emplacement du jeu de données.
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https://open.canada.ca/data/en/dataset/356e92f3-5bf3-4810-98b1-3e10cd7742aa |
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Service de données
Service de données pour accéder à un jeu de données.
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Propriétaire
Propriétaire du jeu de données.
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Fisheries and Oceans Canada | Pêches et Océans Canada |
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Point de contact
Qui contacter concernant l’accès ?
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Government of Canada;Fisheries and Oceans Canada, [email protected] |
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Courriel du point de contact
Courriel à utiliser pour l’accès ?
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Éditeur
Éditeur du jeu de données.
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Courriel de l’éditeur
Adresse courriel de l’éditeur.
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[email protected] |
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Auteur
Auteur du jeu de données.
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Courriel de l'auteur
Adresse courriel de l’auteur.
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Date d’accès
Date à laquelle les données et métadonnées ont été consultées.
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| Champ | Valeur |
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Identifiant
Identifiant unique du jeu de données.
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Langue
Langue(s) du jeu de données
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Lien vers la description du jeu de données
Une URL vers un document externe décrivant le jeu de données.
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Identifiant persistant
Les données sont identifiées par un identifiant persistant.
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Identifiant globalement unique
Les données sont identifiées par un identifiant persistant et globalement unique.
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Contient des données sur des individus
Le jeu de données contient-il des données sur des individus ?
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Contient des données identifiables sur des individus
Le jeu de données contient-il des données identifiables sur des individus ?
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Contient des données autochtones
Le jeu de données contient-il des données sur des communautés autochtones ?
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Type de portail
Type de plateforme du portail source.
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| Champ | Valeur |
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Version
Version du jeu de données
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None |
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Source
Source du jeu de données.
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None |
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Notes de version
Notes de version à propos du jeu de données.
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Est une version d’un autre jeu de données
Lien vers le jeu de données dont celui-ci est une version.
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Autres versions
Lien vers les jeux de données qui en sont des versions.
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Texte de provenance
Texte de provenance des données.
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URL de provenance
URL de provenance des données.
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Résolution temporelle
Décrit la granularité des données temporelles dans le jeu de données.
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Résolution géospatiale en mètres
Décrit la granularité (en mètres) des données géospatiales dans le jeu de données.
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Résolution géospatiale (par régions)
Décrit la granularité (par régions) des données géospatiales dans le jeu de données.
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| Champ | Valeur |
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Permission de la communauté autochtone
Qui détient la permission de la communauté autochtone. Qui contacter pour l’accès à un jeu de données concernant des communautés autochtones.
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Permission communautaire
Permission communautaire (qui a accordé la permission).
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Les communautés autochtones concernées par le jeu de données
Communautés autochtones dont sont issues les données.
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| Champ | Valeur |
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Nombre de lignes de données
Pour un jeu de données tabulaire, nombre total de lignes.
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Nombre de colonnes de données
Pour un jeu de données tabulaire, nombre total de colonnes uniques.
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Nombre de cellules de données
Pour un jeu de données tabulaire, nombre total de cellules contenant des données.
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Nombre de relations de données
Pour un jeu de données RDF, nombre total de triplets.
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Nombre d’entités
Pour un jeu de données RDF, nombre total d’entités.
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Nombre de propriétés de données
Pour un jeu de données RDF, nombre total de propriétés uniques utilisées par les triplets.
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Qualité des données
Décrit la qualité des données du jeu de données.
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Métrique de qualité des données
Une métrique utilisée pour mesurer la qualité des données, telle que les valeurs manquantes ou les formats invalides.
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